Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41P11171 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPB41P11171 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41P11171 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41P11171 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41P11171 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41P11171 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms