Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms