Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms