Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDHBP07195 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDHBP07195 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LDHBP07195 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDHBP07195 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDHBP07195 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms