Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms