Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24BO95487 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms