Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1O95476 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1O95476 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms