Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms