Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F6O75461 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F6O75461 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F6O75461 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F6O75461 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F6O75461 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F6O75461 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F6O75461 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F6O75461 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms