Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD4O60885 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD4O60885 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD4O60885 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD4O60885 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD4O60885 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD4O60885 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms