Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSPAN2O60636 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPAN2O60636 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms