Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD2O60548 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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