Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms