Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms