Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTIFO43310 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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