Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PODXLO00592 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PODXLO00592 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PODXLO00592 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PODXLO00592 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms