Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4O00461 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms