Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARVCFO00192 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms