Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms