Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB9F8W1W9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms