Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF879B4DU55 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms