Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms