Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms