Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms