Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms