Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms