Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms