Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPDC1A2A3K4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPDC1A2A3K4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms