Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms