Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAMTA1Q9Y6Y1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAMTA1Q9Y6Y1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms