Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms