Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMM50Q9Y512 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMM50Q9Y512 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms