Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN4Q9Y3Q4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms