Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL11Q9Y3B7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL11Q9Y3B7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms