Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED5Q9Y3A6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms