Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUDCQ9Y266 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms