Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms