Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms