Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms