Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms