Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRQQ9UMZ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRQQ9UMZ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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