Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms