Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA11Q9UKX5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms