Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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GTF3C4Q9UKN8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GTF3C4Q9UKN8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GTF3C4Q9UKN8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GTF3C4Q9UKN8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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GTF3C4Q9UKN8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C4Q9UKN8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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