Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms