Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCP2D1Q9UJQ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms