Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms