Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO40Q9UH90 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO40Q9UH90 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms