Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms