Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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